Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALUO43852 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALUO43852 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALUO43852 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALUO43852 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALUO43852 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALUO43852 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALUO43852 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALUO43852 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALUO43852 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALUO43852 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CALUO43852 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALUO43852 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CALUO43852 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALUO43852 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALUO43852 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALUO43852 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALUO43852 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALUO43852 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALUO43852 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALUO43852 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALUO43852 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALUO43852 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALUO43852 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALUO43852 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALUO43852 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALUO43852 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALUO43852 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALUO43852 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CALUO43852 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALUO43852 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALUO43852 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALUO43852 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALUO43852 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALUO43852 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALUO43852 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALUO43852 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALUO43852 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALUO43852 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALUO43852 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALUO43852 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALUO43852 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALUO43852 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALUO43852 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CALUO43852 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALUO43852 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALUO43852 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALUO43852 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALUO43852 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CALUO43852 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALUO43852 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALUO43852 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALUO43852 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALUO43852 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALUO43852 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALUO43852 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALUO43852 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALUO43852 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALUO43852 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALUO43852 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALUO43852 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALUO43852 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALUO43852 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALUO43852 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALUO43852 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALUO43852 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALUO43852 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALUO43852 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALUO43852 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALUO43852 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALUO43852 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALUO43852 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALUO43852 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALUO43852 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CALUO43852 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALUO43852 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALUO43852 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CALUO43852 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALUO43852 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALUO43852 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALUO43852 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALUO43852 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CALUO43852 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALUO43852 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALUO43852 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALUO43852 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALUO43852 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CALUO43852 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALUO43852 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALUO43852 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALUO43852 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALUO43852 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALUO43852 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALUO43852 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALUO43852 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALUO43852 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALUO43852 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALUO43852 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALUO43852 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALUO43852 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms