Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGTAO43765 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGTAO43765 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGTAO43765 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGTAO43765 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGTAO43765 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGTAO43765 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGTAO43765 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGTAO43765 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGTAO43765 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGTAO43765 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGTAO43765 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGTAO43765 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGTAO43765 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGTAO43765 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGTAO43765 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGTAO43765 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGTAO43765 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGTAO43765 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SGTAO43765 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGTAO43765 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGTAO43765 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGTAO43765 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SGTAO43765 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SGTAO43765 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SGTAO43765 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGTAO43765 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGTAO43765 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGTAO43765 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGTAO43765 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGTAO43765 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGTAO43765 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGTAO43765 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGTAO43765 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGTAO43765 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGTAO43765 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGTAO43765 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGTAO43765 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGTAO43765 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGTAO43765 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGTAO43765 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGTAO43765 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGTAO43765 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGTAO43765 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGTAO43765 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGTAO43765 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGTAO43765 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGTAO43765 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGTAO43765 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGTAO43765 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGTAO43765 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGTAO43765 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGTAO43765 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGTAO43765 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGTAO43765 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGTAO43765 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SGTAO43765 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGTAO43765 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGTAO43765 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGTAO43765 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGTAO43765 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGTAO43765 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGTAO43765 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGTAO43765 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGTAO43765 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGTAO43765 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGTAO43765 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SGTAO43765 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SGTAO43765 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SGTAO43765 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SGTAO43765 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SGTAO43765 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SGTAO43765 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SGTAO43765 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SGTAO43765 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGTAO43765 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGTAO43765 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGTAO43765 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGTAO43765 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGTAO43765 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGTAO43765 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGTAO43765 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGTAO43765 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGTAO43765 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGTAO43765 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGTAO43765 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGTAO43765 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGTAO43765 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGTAO43765 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGTAO43765 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGTAO43765 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGTAO43765 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGTAO43765 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGTAO43765 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGTAO43765 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGTAO43765 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGTAO43765 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGTAO43765 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGTAO43765 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGTAO43765 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms