Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

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Length 1,280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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ZNF208O43345 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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ZNF208O43345 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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ZNF208O43345 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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ZNF208O43345 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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