Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms