Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBDO15205 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBDO15205 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBDO15205 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBDO15205 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBDO15205 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBDO15205 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBDO15205 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBDO15205 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBDO15205 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBDO15205 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBDO15205 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBDO15205 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBDO15205 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBDO15205 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBDO15205 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBDO15205 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBDO15205 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBDO15205 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBDO15205 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBDO15205 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBDO15205 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBDO15205 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBDO15205 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBDO15205 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBDO15205 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
UBDO15205 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBDO15205 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
UBDO15205 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBDO15205 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
UBDO15205 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBDO15205 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBDO15205 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBDO15205 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBDO15205 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBDO15205 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBDO15205 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBDO15205 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBDO15205 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBDO15205 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBDO15205 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBDO15205 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBDO15205 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBDO15205 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBDO15205 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBDO15205 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBDO15205 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBDO15205 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBDO15205 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBDO15205 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBDO15205 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBDO15205 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBDO15205 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBDO15205 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBDO15205 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBDO15205 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBDO15205 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBDO15205 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBDO15205 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
UBDO15205 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBDO15205 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBDO15205 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBDO15205 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBDO15205 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBDO15205 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBDO15205 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBDO15205 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBDO15205 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
UBDO15205 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBDO15205 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBDO15205 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBDO15205 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBDO15205 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBDO15205 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBDO15205 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
UBDO15205 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
UBDO15205 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
UBDO15205 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
UBDO15205 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBDO15205 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBDO15205 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBDO15205 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBDO15205 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBDO15205 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBDO15205 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBDO15205 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBDO15205 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
UBDO15205 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBDO15205 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBDO15205 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBDO15205 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBDO15205 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBDO15205 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBDO15205 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBDO15205 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBDO15205 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBDO15205 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBDO15205 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBDO15205 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBDO15205 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms