Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM6BO15054 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms