Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC01387J3KSC0 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC01387J3KSC0 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC01387J3KSC0 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC01387J3KSC0 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC01387J3KSC0 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC01387J3KSC0 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC01387J3KSC0 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC01387J3KSC0 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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LINC01387J3KSC0 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC01387J3KSC0 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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LINC01387J3KSC0 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC01387J3KSC0 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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LINC01387J3KSC0 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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LINC01387J3KSC0 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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LINC01387J3KSC0 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC01387J3KSC0 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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LINC01387J3KSC0 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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LINC01387J3KSC0 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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LINC01387J3KSC0 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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LINC01387J3KSC0 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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LINC01387J3KSC0 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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