Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms