Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 899 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRT4C9JH25 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms