Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms