Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms