Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC162PA2VCL2 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms