Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms