Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms