Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTC7AQ9ULT0 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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