Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms