Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms