Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.08■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.08■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.08■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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COPS7AQ9UBW8 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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COPS7AQ9UBW8 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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COPS7AQ9UBW8 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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COPS7AQ9UBW8 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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COPS7AQ9UBW8 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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COPS7AQ9UBW8 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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COPS7AQ9UBW8 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
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