Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms