Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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