Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXB0

MKS1, Meckel syndrome type 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1Q9NXB0 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms