Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms