Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ASCL3Q9NQ33 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ASCL3Q9NQ33 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ASCL3Q9NQ33 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ASCL3Q9NQ33 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ASCL3Q9NQ33 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ASCL3Q9NQ33 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ASCL3Q9NQ33 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ASCL3Q9NQ33 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ASCL3Q9NQ33 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ASCL3Q9NQ33 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ASCL3Q9NQ33 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ASCL3Q9NQ33 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ASCL3Q9NQ33 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ASCL3Q9NQ33 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ASCL3Q9NQ33 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ASCL3Q9NQ33 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ASCL3Q9NQ33 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ASCL3Q9NQ33 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ASCL3Q9NQ33 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ASCL3Q9NQ33 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ASCL3Q9NQ33 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ASCL3Q9NQ33 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ASCL3Q9NQ33 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ASCL3Q9NQ33 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ASCL3Q9NQ33 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ASCL3Q9NQ33 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ASCL3Q9NQ33 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ASCL3Q9NQ33 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ASCL3Q9NQ33 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ASCL3Q9NQ33 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ASCL3Q9NQ33 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ASCL3Q9NQ33 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ASCL3Q9NQ33 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ASCL3Q9NQ33 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ASCL3Q9NQ33 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ASCL3Q9NQ33 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ASCL3Q9NQ33 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ASCL3Q9NQ33 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ASCL3Q9NQ33 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ASCL3Q9NQ33 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ASCL3Q9NQ33 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ASCL3Q9NQ33 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ASCL3Q9NQ33 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ASCL3Q9NQ33 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms