Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms