Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL8

BPESC1, Putative BPES syndrome breakpoint region protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPESC1Q9GZL8 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BPESC1Q9GZL8 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms