Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHACTR1Q9C0D0 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms