Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms