Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 USP3-AS1-204ENST00000559861 620 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 OR13I1P-201ENST00000609811 1264 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC4A5Q9BY07 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms