Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms