Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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