Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms