Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms