Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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PKP4Q99569 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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PKP4Q99569 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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PKP4Q99569 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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PKP4Q99569 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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PKP4Q99569 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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PKP4Q99569 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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PKP4Q99569 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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PKP4Q99569 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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PKP4Q99569 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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PKP4Q99569 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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