Protein–RNA interactions for Protein: Q96S42

NODAL, Nodal homolog, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NODALQ96S42 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms