Protein–RNA interactions for Protein: Q96P64

AGAP4, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP4Q96P64 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms