Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms