Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms