Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG2BQ96BY7 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms