Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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UBE2E3Q969T4 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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UBE2E3Q969T4 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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UBE2E3Q969T4 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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UBE2E3Q969T4 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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