Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms