Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms