Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms