Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms