Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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