Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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