Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms