Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms