Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms