Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms