Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms